图书馆在进行检索时，主要使用以下几种数据库：

1.图书馆目录数据库：图书馆目录数据库是图书馆收录的书籍、期刊、报纸、音像资料等的目录信息数据库。这些目录信息包括书名、作者、出版社、出版日期、ISBN等，用户可以通过关键词、题名、作者、主题等进行检索。

2.学术期刊数据库：学术期刊数据库收录了大量的学术期刊文章，包括自然科学、社会科学、人文科学等各个学科领域的文章。用户可以通过关键词、作者、期刊名称等进行检索。

3.数据库索引：数据库索引是对数据库中的各种数据进行分类、整理和索引的工具。图书馆可以建立自己的数据库索引，将图书馆收藏的各种资料进行分类整理，并提供检索功能给用户使用。

4.数字图书馆：数字图书馆是将图书馆的藏书数字化并提供在线访问的平台。用户可以通过数字图书馆进行文献检索、在线阅读、下载等操作。

5.外部数据库：图书馆还可以订阅或购买外部的数据库，如知网、万方、EBSCO等。这些数据库涵盖了大量的学术论文、期刊、报纸、图书等，用户可以通过图书馆提供的访问权限进行检索和使用。

在使用这些数据库进行检索时，用户通常需要使用检索工具或平台，如图书馆提供的在线检索系统、数据库的官方网站或专门的检索软件。用户可以根据自己的需求选择合适的数据库和检索工具，并通过关键词、标题、作者、主题等进行检索。同时，用户还可以利用数据库提供的高级检索功能，如按照文献类型、出版日期、语言等进行筛选和排序。